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El
proyecto está diseñado para explorar la contribución genética al proceso de
la senescencia. Se le ha dado un
enfoque evolutivo al análisis de un tamizaje genómico, esto es, se buscará
comprobar teorías que explican la causa biológica de la senescencia mediante
la detección de regiones con desequilibrio de ligamiento. Este plan piloto pretende desarrollar una
búsqueda en una muestra inicial de individuos costarricenses mayores de 90
años (que tienen la expectativa de vida más alta del mundo), comparándolos
con neonatos. Por otra parte, pretende
realizar dos estudios focalizados sobre genes asociados a factores que
afectan la expectativa de vida, como son la obesidad y las enfermedades
psiquiátricas. La información
producida puede contribuir en la comprensión de fenómenos fundamentales como
son la longevidad, la obesidad y diversas enfermedades psiquiátricas.
Objetivo
del tamizaje genómico
Con la realización del presente
proyecto se pretende explorar las causas evolutivas (distales) de la
senescencia y contribuir así a
entender las razones por las cuales el fenómeno existe, tratando de aportar
evidencia que contribuya a verificar las consecuencias de tres teorías muy
acreditadas: 1. la teoría de la acumulación de mutaciones (Martin et al. 1996, Nature Genet 13: 25-34), 2. la teoría del ajuste -en
inglés trade-off- (Williams 1957, Evolution 11: 398-411), también
llamada de la pleiotropía antagonista, y, 3. la teoría del soma descartable
(Kirkwood 1977, Nature 270: 301-304), que podría
ser un caso especial de la teoría del ajuste
No se busca, en primera instancia,
encontrar causas proximales de la senescencia, aunque con los estudios
focalizados se explorarán genes
asociados a la obesidad y a enfermedades siquiátricas (ver abajo). Una
vez realizado este propósito, los resultados podrían señalar sitios genómicos
donde se encontrarían genes cuya acción podría ser importante en determinar
las diferencias en las tasas de senescencia entre individuos, sitios que hoy
en día ni se sospecha que pueda haber genes involucrados en el fenómeno.
Estado del
estudio:
El
estudio genómico que fue posible financiar con los fondos aportados por
FORINVES, a los que se sumaron aportes del programa CRELES del Centro
Centroamericano de Población (con fondos de la Wellcome Trust) y de la
Vicerrectoría de Investigación de la UCR, es un plan piloto con un total de
47 muestras, 24 individuos mayores de 90 años y 23 controles de edades entre
los 65 y 70 años, a cada una de las cuales se les está analizando más de 800
000 SNPs. El análisis se contrató al Broad Institute, Cambridge,
Massachussets, EEUU, y los resultados
han de estar listos a fines de setiembre de 2010, por lo que los análisis de
las zonas con desequilibrio de ligamiento se realizarán en los meses
siguientes.
Objetivo de
los estudios focalizados
Comparar las frecuencias génicas
y genotípicas de polimorfismos relacionados con la obesidad (2548G>A en el gen de la leptina
(LEP), Q223R en el gen del receptor de leptina (LEPR) y P12A en el gen PPARgamma2) así como
de polimorfismos en la región del promotor del gen SCL6A4 en dos estratos generacionales (adultos mayores y recién
nacidos), pertenecientes a una misma población.
Resultados de los estudios focalizados
a) Resultados de polimorfismos
ligados a un genes relacionados con obesidad
Los
experimentos con los genes LEP, LEPR y P12A están en su fase final.
b) Resultados de polimorfismos
cercanos a un gen relacionado con enfermedades psiquiátricas (transportador
de la serotonina)
Se
compararon los polimorfismos 5HTTLPR y Stin2 del gen SCL6A4 (asociado a diversas enfermedades psiquiátricas) entre 100
individuos cuasi-centenarios del país y 100 neonatos nacidos en Costa
Rica. Se aplicó la prueba estadística
de Monte Carlo (recomendada para
loci con más de dos alelos).
La prueba
de diferenciación poblacional para el polimorfismo 5HTTLPR indicó que las
diferencias entre ambos subgrupos no era significativa.
A pesar
de esto, la prueba arroja un resultado que está muy cercano al punto de corte
de admisibilidad estadística: P = 0.07, S.E. 0.02.
Esta
misma prueba para Stin2 comprobó que existen diferencias significativas entre
los ancianos y los recién nacidos: P = 0.01, S.E. 0.00.
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